Bos taurus Gene: RAPGEF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640087.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAPGEF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107263:
This gene encodes a human guanine nucleotide exchange factor. It transduces signals from CRK by binding the SH3 domain of CRK, and activating several members of the Ras family of GTPases. This signaling cascade that may be involved in apoptosis, integrin-mediated signal transduction, and cell transformation. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:101728372-101793685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TCR pathway
BCR pathway
IL3 pathway
IL5 pathway
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REACTOME |
Regulation of signaling by CBL pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Frs2-mediated activation pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Signalling by NGF pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Signal Transduction pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Signalling to ERKs pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Prolonged ERK activation events pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Insulin signaling pathway pathway
Focal adhesion pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Renal cell carcinoma pathway
Insulin signaling pathway pathway
Focal adhesion pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
GPCR Adenosine A2A receptor signaling pathway pathway
HGF signaling pathway pathway
GPCR signaling pathway
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PID NCI |
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Reelin signaling pathway
Nectin adhesion pathway
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
EPO signaling pathway
Neurotrophic factor-mediated Trk receptor signaling
PDGFR-alpha signaling pathway
PDGFR-beta signaling pathway
Insulin Pathway
IFN-gamma pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_005213263 XM_005213266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||