Mus musculus Gene: Rapgef1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153837.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rapgef1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4932418O06Rik; C3G; Grf2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107263:
This gene encodes a human guanine nucleotide exchange factor. It transduces signals from CRK by binding the SH3 domain of CRK, and activating several members of the Ras family of GTPases. This signaling cascade that may be involved in apoptosis, integrin-mediated signal transduction, and cell transformation. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:29619720-29740978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Insulin signaling pathway pathway
Focal adhesion pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TCR pathway
BCR pathway
IL3 pathway
IL5 pathway
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REACTOME |
Regulation of signaling by CBL pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Frs2-mediated activation pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Signalling by NGF pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Signal Transduction pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Signalling to ERKs pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Prolonged ERK activation events pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Insulin signaling pathway pathway
Focal adhesion pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
GPCR Adenosine A2A receptor signaling pathway pathway
HGF signaling pathway pathway
GPCR signaling pathway
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PID NCI |
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Reelin signaling pathway
Nectin adhesion pathway
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
EPO signaling pathway
Neurotrophic factor-mediated Trk receptor signaling
PDGFR-alpha signaling pathway
PDGFR-beta signaling pathway
Insulin Pathway
IFN-gamma pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8C5V7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 107746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.298274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006497589 XM_006497590 NM_001039086 NM_001039087 NM_054050 XM_006497582 XM_006497583 XM_006497584 XM_006497585 XM_006497586 XM_006497588 XM_006497591 XM_006497592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15854 CCDS38091 CCDS38092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rapgef1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK077034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAC36578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 107746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||