Bos taurus Gene: PICALM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-641926.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PICALM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000001657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000073921:
This gene encodes a clathrin assembly protein, which recruits clathrin and adaptor protein complex 2 (AP2) to cell membranes at sites of coated-pit formation and clathrin-vesicle assembly. The protein may be required to determine the amount of membrane to be recycled, possibly by regulating the size of the clathrin cage. The protein is involved in AP2-dependent clathrin-mediated endocytosis at the neuromuscular junction. A chromosomal translocation t(10;11)(p13;q14) leading to the fusion of this gene and the MLLT10 gene is found in acute lymphoblastic leukemia, acute myeloid leukemia and malignant lymphomas. The polymorphisms of this gene are associated with the risk of Alzheimer disease. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 29:9613012-9665840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 513579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.7758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001101977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02062547 DAAA02062548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 513579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||