Bos taurus Gene: PRKDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644289.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRKDC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Vaccinia virus protein C16 influences the immune response by binding to the XRCC6/XRCC5 (Ku70/80) complex thus blocking PRKDC-dependent DNA sensing in fibroblast.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000253729:
This gene encodes the catalytic subunit of the DNA-dependent protein kinase (DNA-PK). It functions with the Ku70/Ku80 heterodimer protein in DNA double strand break repair and recombination. The protein encoded is a member of the PI3/PI4-kinase family.[provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:21038513-21164037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 202 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
DNA Repair pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
Non-homologous end-joining pathway
Cell cycle pathway
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Class I PI3K signaling events mediated by Akt
Coregulation of Androgen receptor activity
BARD1 signaling events
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BLB6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 512740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.11314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001256559 XM_005215361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02038231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 512740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||