Bos taurus Gene: XRCC4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646520.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XRCC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA repair protein XRCC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000024275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA repair protein XRCC4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152422:
The protein encoded by this gene functions together with DNA ligase IV and the DNA-dependent protein kinase in the repair of DNA double-strand break by non-homologous end joining and the completion of V(D)J recombination events. The non-homologous end-joining pathway is required both for normal development and for suppression of tumors. This gene functionally complements XR-1 Chinese hamster ovary cell mutant, which is impaired in DNA double-strand breaks produced by ionizing radiation and restriction enzymes. Alternative transcription initiation and alternative splicing generates several transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:85267807-85556934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
2-LTR circle formation pathway
Integration of provirus pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
Double-Strand Break Repair pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
ATM pathway
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2VDW3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 613590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.63314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081615 XM_005209722 XM_005209723 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC133433 DAAA02021059 DAAA02021060 DAAA02021061 DAAA02021062 DAAA02021063 DAAA02021064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI33434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 613590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||