Mus musculus Gene: Xrcc4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-171005.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Xrcc4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310057B22Rik; AW413319; AW545101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152422:
The protein encoded by this gene functions together with DNA ligase IV and the DNA-dependent protein kinase in the repair of DNA double-strand break by non-homologous end joining and the completion of V(D)J recombination events. The non-homologous end-joining pathway is required both for normal development and for suppression of tumors. This gene functionally complements XR-1 Chinese hamster ovary cell mutant, which is impaired in DNA double-strand breaks produced by ionizing radiation and restriction enzymes. Alternative transcription initiation and alternative splicing generates several transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:89774027-90089608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Double-Strand Break Repair pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
2-LTR circle formation pathway
Integration of provirus pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
Double-Strand Break Repair pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
ATM pathway
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_028012 XM_006517041 XM_006517042 XM_006517043 XM_006543099 XM_006543100 XM_006543101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||