Homo sapiens Gene: TRIM9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-6467.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 9 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100505 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 9
tripartite motif containing 9
tripartite motif containing 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM9 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. Its function has not been identified. Alternate splicing of this gene generates two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:50975262-51096061 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9C026 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 114088 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.604723 Hs.654750 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_015163 NM_052978 XM_006720017 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16288 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606555 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45105 CCDS9703 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF220036 AF220037 AF220038 AK055388 BC013414 BC063872 CH471078 D87458 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG53490 AAG53491 AAG53492 AAH13414 AAH63872 BAA13398 BAB70913 EAW65680 EAW65681 EAW65682 EAW65684 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 114088 | ||||||||||||||||||||||