Homo sapiens Gene: TRPC6 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68841.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRPC6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FSGS2; TRP6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000137672 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6
transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene forms a receptor-activated calcium channel in the cell membrane. The channel is activated by diacylglycerol and is thought to be under the control of a phosphatidylinositol second messenger system. Activation of this channel occurs independently of protein kinase C and is not triggered by low levels of intracellular calcium. Defects in this gene are a cause of focal segmental glomerulosclerosis 2 (FSGS2). [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:101451564-101872562 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Elevation of cytosolic Ca2+ levels pathway
Platelet homeostasis pathway
Effects of PIP2 hydrolysis pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
Role of second messengers in netrin-1 signaling pathway
Netrin-1 signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Developmental Biology pathway
Platelet calcium homeostasis pathway
Signaling by GPCR pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Axon guidance pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Ion channel transport pathway
TRP channels pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nephrin/Neph1 signaling in the kidney podocyte
PAR1-mediated thrombin signaling events
Endothelins
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.159003 Hs.600819 Hs.622646 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004621 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8311 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04710 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||