Homo sapiens Gene: ATG16L1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83447.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG16L1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000085978 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
ATG16 autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
ATG16L1 is involved in autophagy where it is recruited to the plasma membrane at the site of bacterial entry by NOD1 and NOD2.
ATG16L1, a critical autophagy protein, is recruited to the plasma membrane by NOD2 during bacterial invasion.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is part of a large protein complex that is necessary for autophagy, the major process by which intracellular components are targeted to lysosomes for degradation. Defects in this gene are a cause of susceptibility to inflammatory bowel disease type 10 (IBD10). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:233210051-233295674 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q37.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 57 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.529322 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001190266 NM_001190267 NM_017974 NM_030803 NM_198890 XM_005246082 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2502 CCDS2503 CCDS54438 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16498 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||