Homo sapiens Gene: SET | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-88484.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SET | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SET nuclear oncogene | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2PP2A; I2PP2A; IGAAD; IPP2A2; PHAPII; TAF-I; TAF-IBETA | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000119335 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SET nuclear oncogene
SET nuclear oncogene
SET nuclear oncogene
SET nuclear oncogene
SET nuclear oncogene
SET nuclear oncogene
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene inhibits acetylation of nucleosomes, especially histone H4, by histone acetylases (HAT). This inhibition is most likely accomplished by masking histone lysines from being acetylated, and the consequence is to silence HAT-dependent transcription. The encoded protein is part of a complex localized to the endoplasmic reticulum but is found in the nucleus and inhibits apoptosis following attack by cytotoxic T lymphocytes. This protein can also enhance DNA replication of the adenovirus genome. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:128683424-128696400 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q34.11 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 149 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 36 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HuR stabilizes mRNA pathway
Condensation of Prophase Chromosomes pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic Prophase pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.436687 Hs.645039 Hs.717381 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001122821 NM_001248000 NM_001248001 NM_003011 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS48037 CCDS59149 CCDS59150 CCDS6907 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09023 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||