Version 5.4
| Mus musculus Gene: Clec5a | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-139294.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Clec5a | ||||||||||||||||||
| Gene Name | C-type lectin domain family 5, member a | ||||||||||||||||||
| Synonyms | Clecsf5; Ly100; MDL-1; Mdl1 | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000029915 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
C-type lectin domain family 5, member a
C-type lectin domain family 5, member a
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000258227:
This gene encodes a member of the C-type lectin/C-type lectin-like domain (CTL/CTLD) superfamily. Members of this family share a common protein fold and have diverse functions, such as cell adhesion, cell-cell signalling, glycoprotein turnover, and roles in inflammation and immune response. The encoded type II transmembrane protein interacts with dnax-activation protein 12 and may play a role in cell activation. Alternative splice variants have been described but their full-length sequence has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 6:40574894-40585821 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | B1 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
DAP12 interactions pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
DAP12 interactions pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9R007 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 23845 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.103765 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_021364 NM_001038604 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS20037 CCDS20036 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| MGI ID | MGI:1345151 | ||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Clec5a | ||||||||||||||||||
| EMBL | AF139769 AK036697 AK046600 AK137482 BC104364 BC104365 CH466533 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAF02492 AAI04365 AAI04366 BAC29537 BAC32802 BAE23374 EDL13570 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 23845 | ||||||||||||||||||