Mus musculus Gene: Vps36 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140065.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vps36 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 36 (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700010A24Rik; 2210415M20Rik; 2810408E15Rik; Eap45 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031479 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 36 (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000136100:
VPS36, VPS22 (SNF8; MIM 610904), and VPS25 (MIM 610907) form ESCRT-II (endosomal sorting complex required for transport II), a complex involved in endocytosis of ubiquitinated membrane proteins. VPS36, VPS22, and VPS25 are also associated in a multiprotein complex with RNA polymerase II elongation factor (ELL; MIM 600284) (Slagsvold et al., 2005 [PubMed 15755741]; Kamura et al., 2001 [PubMed 11278625]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:22192809-22220843 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane Trafficking pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.41453 Mm.474298 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_027338 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22171 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||