Mus musculus Gene: Tyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145030.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | thymidylate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Ts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
thymidylate synthase
thymidylate synthase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an enzyme that catalyzes the methylation of deoxyuridylate to deoxythymidylate using 5,10-methylenetetrahydrofolate as a cofactor. This function maintains the thymidine-5-prime monophosphate concentration critical for DNA replication and repair. The encoded enzyme is a target for cancer chemotherapeutic agents. The majority of transcripts for this gene lack a 3' UTR (PMID: 3022294, 3444407). The stop codon in these transcripts is UAA, compared to the UAG found in the genome and longer transcripts, as the polyA site is located within the stop codon (PMID: 3444407, 2157203). A related pseudogene has been identified on chromosome 10. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes an enzyme that catalyzes the methylation of deoxyuridylate to deoxythymidylate using 5,10-methylenetetrahydrofolate as a cofactor. This function maintains the thymidine-5-prime monophosphate concentration critical for DNA replication and repair. The encoded enzyme is a target for cancer chemotherapeutic agents. The majority of transcripts for this gene lack a 3\' UTR (PMID: 3022294, 3444407). The stop codon in these transcripts is UAA, compared to the UAG found in the genome and longer transcripts, as the polyA site is located within the stop codon (PMID: 3444407, 2157203). A related pseudogene has been identified on chromosome 10. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:30058202-30073617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Pyrimidine biosynthesis pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Pyrimidine metabolism pathway
Cell Cycle pathway
Metabolism pathway
G1/S Transition pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
G1/S-Specific Transcription pathway
E2F mediated regulation of DNA replication pathway
Metabolism of nucleotides pathway
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KEGG |
Pyrimidine metabolism pathway
One carbon pool by folate pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G1/S-Specific Transcription pathway
E2F mediated regulation of DNA replication pathway
Pyrimidine biosynthesis pathway
Metabolism of nucleotides pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
G1/S Transition pathway
Cell Cycle pathway
Pyrimidine metabolism pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Pyrimidine metabolism pathway
One carbon pool by folate pathway
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INOH |
Folate metabolism pathway
Pyrimidine nucleotides nucleosides metabolism pathway
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PID NCI |
E2F transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.268395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||