Mus musculus Gene: Pdlim1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164550.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pdlim1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ and LIM domain 1 (elfin) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Clim1; CLP36; mClim1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000055044 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ and LIM domain 1 (elfin)
PDZ and LIM domain 1 (elfin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107438:
This gene encodes a member of the enigma protein family. The protein contains two protein interacting domains, a PDZ domain at the amino terminal end and one to three LIM domains at the carboxyl terminal. It is a cytoplasmic protein associated with the cytoskeleton. The protein may function as an adapter to bring other LIM-interacting proteins to the cytoskeleton. Pseudogenes associated with this gene are located on chromosomes 3, 14 and 17. [provided by RefSeq, Oct 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:40221173-40271842 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016861 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37977 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||