Mus musculus Gene: Tap1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170616.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tap1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP) | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ABC17; Abcb2; APT1; Ham-1; Ham1; MTP1; PSF1; RING4; TAP; Tap-1; Y3 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000037321 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)
transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)
transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MDR/TAP subfamily. Members of the MDR/TAP subfamily are involved in multidrug resistance. This protein forms a heterodimer with Tap2 that transports short peptides from the cytosol into the endoplasmic reticulum lumen. Mutations in the human gene may be associated with ankylosing spondylitis, insulin-dependent diabetes mellitus, and celiac disease. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:34187553-34197225 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 31 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
ER-Phagosome pathway pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC pathway
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KEGG |
Antigen processing and presentation pathway
ABC transporters pathway
Primary immunodeficiency pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC pathway
ER-Phagosome pathway pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG |
Antigen processing and presentation pathway
ABC transporters pathway
Primary immunodeficiency pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.482076 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001161730 NM_013683 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28643 CCDS50072 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||