Mus musculus Gene: Des | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170899.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Des | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | desmin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026208 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
desmin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a muscle-specific class III intermediate filament. Homopolymers of this protein form a stable intracytoplasmic filamentous network connecting myofibrils to each other and to the plasma membrane and are essential for maintaining the strength and integrity of skeletal, cardiac and smooth muscle fibers. Mutations in this gene affect assembly of intermediate filaments. Mice lacking this gene are able to develop and reproduce but exhibit abnormal muscle fibers. Mutations in the human gene are associated with myofibrillar myopathy, dilated cardiomyopathy, neurogenic scapuloperoneal syndrome and autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy, type 2R. [provided by RefSeq, Jan 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:75360329-75368579 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
Muscle contraction pathway
Striated Muscle Contraction pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Aurora B signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P31001 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3V1K9 Q9JJY2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13346 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.6712 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010043 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15071 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:94885 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Des | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ250633 AK132391 BC031760 L22550 Z18892 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH31760 BAE21141 CAA79330 CAB93654 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13346 | ||||||||||||||||||||||