Mus musculus Gene: Irf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172251.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU020929; Irf-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
interferon regulatory factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Irf1 transcriptionally inhibits the Il23a through the ISRE element and reduce the severity of chronic intestinal inflammation caused by LPS.
Irf1 promotes immune cell apoptosis and inhibits autophagy in a murine endotoxemia model.
Irf1 is an essential regulator of the host innate antiviral response in the brain by limiting viral replication at later stages of infection, but is not involved in the rapid induction of IFN.
Nlrp3 deficiency protects mice from the development of type 1 diabetes by suppressing Th1 responses and impairing T-cell migration to pancreatic islets through the down-regulation of chemokine expression (Ccl5, Cxcl10, Irf1) in islets.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] IRF1 is required for the up-regulation of the CD40-NF-kappaB activator 1 (TRAF3IP2 ) axis during airway inflammation.
[Homo sapiens] IRF1 is controlled by two distinct signalling pathways; a JAK/STAT-signalling pathway in viral infected cells and an ATM-signalling pathway in DNA damaged cells.
[Homo sapiens] IRF1 specifically binds to the upstream regulatory region of the human IFN-beta (IFNB1) gene and mediates IFNB1 virus-induced transcription and is involved in the regulation of other genes such as IFN-alpha and MHC class I genes.
[Homo sapiens] IRF1 mediated type I IFN independent mechanism of enhanced RSAD2 (viperin) expression provides a redundant mechanism to protect cells from viral infections.
[Homo sapiens] IRF1 transcriptionally inhibits the IL23A through the ISRE element and reduce the severity of chronic intestinal inflammation caused by LPS (shown in mice).
[Homo sapiens] IRF1 promotes immune cell apoptosis and inhibits autophagy in a murine endotoxemia model. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] MIR23A contributes to human herpes simplex virus type 1 replication through the regulation of the IRF1-mediated antiviral signal pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000125347:
IRF1 encodes interferon regulatory factor 1, a member of the interferon regulatory transcription factor (IRF) family. IRF1 serves as an activator of interferons alpha and beta transcription, and in mouse it has been shown to be required for double-stranded RNA induction of these genes. IRF1 also functions as a transcription activator of genes induced by interferons alpha, beta, and gamma. Further, IRF1 has been shown to play roles in regulating apoptosis and tumor-suppressoion. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:53770014-53778374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 83 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 120 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Hemostasis pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Interferon gamma signaling pathway
Interferon Signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
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KEGG |
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
Hemostasis pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Hemostasis pathway
Immune System pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
Innate Immune System pathway
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KEGG |
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
IL12 signaling mediated by STAT4
Glucocorticoid receptor regulatory network
IL6-mediated signaling events
Regulation of Telomerase
IFN-gamma pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001159393 NM_001159396 NM_008390 XM_006532308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24686 CCDS48796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||