Mus musculus Gene: Hdac7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179042.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hdac7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone deacetylase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5830434K02Rik; HD7; HD7a; Hdac7a; mFLJ00062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
histone deacetylase 7
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000061273:
Histones play a critical role in transcriptional regulation, cell cycle progression, and developmental events. Histone acetylation/deacetylation alters chromosome structure and affects transcription factor access to DNA. The protein encoded by this gene has sequence homology to members of the histone deacetylase family. This gene is orthologous to mouse HDAC7 gene whose protein promotes repression mediated via the transcriptional corepressor SMRT. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:97792664-97844502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 109 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Disease pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
TCR pathway
BCR pathway
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REACTOME |
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class II
HIF-1-alpha transcription factor network
Regulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204275 NM_001204276 NM_001204277 NM_001204278 NM_001204279 NM_001204280 NM_001204281 NM_019572 XM_006521197 XM_006521198 XM_006521199 XM_006521201 XM_006521202 XM_006521203 XM_006521204 XM_006521205 XM_006521206 XM_006521207 XM_006521208 XM_006521209 XM_006521210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37188 CCDS57001 CCDS57002 CCDS57003 CCDS57004 CCDS57005 CCDS57006 CCDS57007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||