Mus musculus Gene: Cxcl12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-180998.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cxcl12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-X-C motif) ligand 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Pbsf; Scyb12; Sdf1; Tlsf; Tpar1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000061353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-X-C motif) ligand 12
chemokine (C-X-C motif) ligand 12
chemokine (C-X-C motif) ligand 12
chemokine (C-X-C motif) ligand 12
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] MIR141 directly regulates CXCL12 expression and CXCL12 mediated leukocyte migration during colonic inflammation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the intercrine-macrophage inflammatory protein superfamily. It is a secreted protein thought to be involved in the generation and proliferation of early B-cell progenitors. Three transcript variants encoding three different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the alpha chemokine protein family. The encoded protein is secreted and functions as the ligand for the G-protein coupled receptor, chemokine (C-X-C motif) receptor 4. The encoded protein plays a role in many diverse cellular functions, including embryogenesis, immune surveillance, inflammation response, tissue homeostasis, and tumor growth and metastasis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:117168535-117181367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear signaling by ERBB4 pathway
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by ERBB4 pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Axon guidance pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Nuclear signaling by ERBB4 pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CXCR4-mediated signaling events
HIF-1-alpha transcription factor network
Syndecan-4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.303231 Mm.407920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001012477 NM_013655 NM_021704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20463 CCDS39605 CCDS39606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||