Mus musculus Gene: Tnfrsf1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189844.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tnfrsf1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD120a; FPF; p55; p55-R; TNF-alphaR1; TNF-R; TNF-R-I; TNF-R1; TNF-R55; TNFalpha-R1; TNFAR; Tnfr-2; Tnfr1; TNFR60; TNFRI; TNFRp55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Tnfrsf1a modulates nitric oxide production in peritoneal macrophages in response to Yersinia LPS stimulation through the Il6 and NFkB signalling pathway.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Recruitment of TNF receptor 1 to lipid rafts is essential for TNFalpha-mediated NF-kappaB activation
[Homo sapiens] TNFR1 mediates TRAF2 phosphorylation and recruitment of the IKK complex
[Homo sapiens] TNFRSF1A modulates nitric oxide production in peritoneal macrophages in response to Yersinia LPS stimulation through the IL6 and NFkB signalling pathway. (Demonstrated in mouse)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000067182:
The protein encoded by this gene is a member of the TNF-receptor superfamily. This protein is one of the major receptors for the tumor necrosis factor-alpha. This receptor can activate NF-kappaB, mediate apoptosis, and function as a regulator of inflammation. Antiapoptotic protein BCL2-associated athanogene 4 (BAG4/SODD) and adaptor proteins TRADD and TRAF2 have been shown to interact with this receptor, and thus play regulatory roles in the signal transduction mediated by the receptor. Germline mutations of the extracellular domains of this receptor were found to be associated with the autosomal dominant periodic fever syndrome. The impaired receptor clearance is thought to be a mechanism of the disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:125349362-125362484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 52 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 159 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptosis pathway
TNF signaling pathway
Death Receptor Signalling pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Alzheimer's disease pathway
MAPK signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Apoptosis pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Osteoclast differentiation pathway
Toxoplasmosis pathway
Hepatitis C pathway
Chagas disease (American trypanosomiasis) pathway
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INOH |
TNFR1 signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
TNF signaling pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
Apoptosis pathway
Death Receptor Signalling pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
MAPK signaling pathway pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Alzheimer's disease pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Chagas disease (American trypanosomiasis) pathway
Osteoclast differentiation pathway
Toxoplasmosis pathway
Hepatitis C pathway
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INOH |
TNFR1 signaling pathway pathway
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PID NCI |
Ceramide signaling pathway
Caspase Cascade in Apoptosis
TNF receptor signaling pathway
Signaling events mediated by HDAC Class I
Canonical NF-kappaB pathway
HIV-1 Nef: Negative effector of Fas and TNF-alpha
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1258 Mm.452214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1314884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tnfrsf1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||