Mus musculus Gene: Smarcc2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197552.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smarcc2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5930405J04Rik | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025369 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000139613:
The protein encoded by this gene is a member of the SWI/SNF family of proteins, whose members display helicase and ATPase activities and which are thought to regulate transcription of certain genes by altering the chromatin structure around those genes. The encoded protein is part of the large ATP-dependent chromatin remodeling complex SNF/SWI and contains a predicted leucine zipper motif typical of many transcription factors. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:128459236-128490173 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 105 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Glucocorticoid receptor regulatory network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.417338 Mm.473618 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001114096 NM_001114097 NM_198160 XM_006514022 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24278 CCDS48726 CCDS48727 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||