Homo sapiens Gene: GTF2H4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-237742.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GTF2H4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | P52; TFB2; TFIIH; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa
general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa
general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:30908184-30914106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 39 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Method
Confidence
Comments
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
Formation of the Early Elongation Complex pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Escape pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
Dual incision reaction in GG-NER pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Formation of HIV-1 elongation complex containing HIV-1 Tat pathway
RNA Polymerase I Transcription Termination pathway
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript pathway
Formation of RNA Pol II elongation complex pathway
HIV Transcription Elongation pathway
Formation of HIV elongation complex in the absence of HIV Tat pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
HIV Life Cycle pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
mRNA Capping pathway
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Transcription of the HIV genome pathway
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE pathway
RNA Polymerase II Transcription Elongation pathway
HIV Infection pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
HIV Transcription Initiation pathway
Formation of the HIV-1 Early Elongation Complex pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
DNA Repair pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID BIOCARTA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.485070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||