Homo sapiens Gene: LTB | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-302504.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LTB | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | p33; TNFC; TNFSF3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000227507 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)
lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Lymphotoxin beta is a type II membrane protein of the TNF family. It anchors lymphotoxin-alpha to the cell surface through heterotrimer formation. The predominant form on the lymphocyte surface is the lymphotoxin-alpha 1/beta 2 complex (e.g. 1 molecule alpha/2 molecules beta) and this complex is the primary ligand for the lymphotoxin-beta receptor. The minor complex is lymphotoxin-alpha 2/beta 1. LTB is an inducer of the inflammatory response system and involved in normal development of lymphoid tissue. Lymphotoxin-beta isoform b is unable to complex with lymphotoxin-alpha suggesting a function for lymphotoxin-beta which is independent of lympyhotoxin-alpha. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:31580525-31582522 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002341 NM_009588 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4703 CCDS4704 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02987 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||