Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SPECC1 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-35228.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SPECC1 | ||||||||||||||||||||||
| Gene Name | sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000128487 | ||||||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the cytospin-A family. It is localized in the nucleus, and highly expressed in testis and some cancer cell lines. A chromosomal translocation involving this gene and platelet-derived growth factor receptor, beta gene (PDGFRB) may be a cause of juvenile myelomonocytic leukemia. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 17:20009344-20319026 | ||||||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
| Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.291530 Hs.431045 Hs.617529 Hs.738760 Hs.740153 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001033553 NM_001033554 NM_001033555 NM_001243438 NM_001243439 NM_152904 XM_005256859 XM_006721592 XM_006721593 XM_006721594 | ||||||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS32590 CCDS42280 CCDS42281 CCDS45628 CCDS58531 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | 12301 | ||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||