Homo sapiens Gene: VPS54 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-53799.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS54 | ||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000143952 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes for a protein that in yeast forms part of a trimeric vacuolar-protein-sorting complex that is required for retrograde transport of proteins from prevacuoles to the late Golgi compartment. As in yeast, mammalian Vps54 proteins contain a coiled-coil region and dileucine motifs. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:63892146-64019072 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p14 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9P1Q0 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51542 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001005739 NM_016516 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18652 | ||||||||||||||||||
OMIM | 614633 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33208 CCDS46302 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF102177 AK002205 AL137604 AL359939 AY444798 BC030275 BC041868 CR749701 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAF37319 AAH30275 AAH41868 AAS20945 BAA92134 CAB70837 CAB95772 CAH18479 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51542 | ||||||||||||||||||