Homo sapiens Gene: SPOP | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-57724.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SPOP | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | speckle-type POZ protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BTBD32; TEF2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000121067 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
speckle-type POZ protein
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that may modulate the transcriptional repression activities of death-associated protein 6 (DAXX), which interacts with histone deacetylase, core histones, and other histone-associated proteins. In mouse, the encoded protein binds to the putative leucine zipper domain of macroH2A1.2, a variant H2A histone that is enriched on inactivated X chromosomes. The BTB/POZ domain of this protein has been shown in other proteins to mediate transcriptional repression and to interact with components of histone deacetylase co-repressor complexes. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:49598884-49678234 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 42 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Hedgehog signaling events mediated by Gli proteins
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001007226 NM_001007227 NM_001007228 NM_001007229 NM_001007230 NM_003563 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11551 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16004 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||