Bos taurus Gene: CDK5R1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-647094.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDK5R1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Cyclin-dependent kinase 5 activator 1 Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, p35 Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, p25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | P25/P35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000004475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Cyclin-dependent kinase 5 activator 1Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, p35Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, p25
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000176749:
The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer's disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer\'s disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:18027469-18028392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Axon guidance pathway
Semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
CRMPs in Sema3A signaling pathway
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KEGG |
Alzheimer's disease pathway
Alzheimer's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Trk receptor signaling mediated by the MAPK pathway
Reelin signaling pathway
Glucocorticoid receptor regulatory network
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.103335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||