Mus musculus Gene: Cdk5r1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204311.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdk5r1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cdk5r; D11Bwg0379e; p25; p35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000048895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35)
cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000176749:
The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer's disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer\'s disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:80477023-80481184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
CRMPs in Sema3A signaling pathway
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KEGG |
Alzheimer's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Axon guidance pathway
Semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG |
Alzheimer's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Trk receptor signaling mediated by the MAPK pathway
Reelin signaling pathway
Glucocorticoid receptor regulatory network
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P61809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AQH0 Q542T9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.142275 Mm.396698 Mm.470880 Mm.472214 Mm.474282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:101764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cdk5r1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF121847 AK079557 AK141549 AK169667 AL591146 BC046823 BC050768 BC058697 CH466556 S82819 U89527 Y11335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB46777 AAB49474 AAD21195 AAH46823 AAH50768 AAH58697 BAC37683 BAE24731 BAE41289 CAA72176 EDL15645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||