Homo sapiens Gene: KDM4A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-97512.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM4A | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 4A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | JHDM3A; JMJD2; JMJD2A; TDRD14A | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000066135 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 4A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] The noncanonical NFκB pathway regulates histone modifications at the Ifnb1 promoter resulting in attenuated recruitment of Rela and histone demethylase, Kdm4a, to the Ifnb1 promoter. This provides a mechanism for regulating the induction of type I interferons .
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the Jumonji domain 2 (JMJD2) family and encodes a protein containing a JmjN domain, a JmjC domain, a JD2H domain, two TUDOR domains, and two PHD-type zinc fingers. This nuclear protein functions as a trimethylation-specific demethylase, converting specific trimethylated histone residues to the dimethylated form, and as a transcriptional repressor. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:43650158-43705515 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p34.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.155983 Hs.607166 Hs.620827 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014663 XM_005271354 XM_005271355 XM_005271356 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS491 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 17168 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||