Mus musculus Gene: Xrcc6 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-165874.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Xrcc6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 70kDa; G22p1; Ku70 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022471 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Vaccinia virus protein C16 influences the immune response by binding to the XRCC6/XRCC5 (Ku70/80) complex thus blocking PRKDC-dependent DNA sensing in fibroblasts
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000196419:
The p70/p80 autoantigen is a nuclear complex consisting of two subunits with molecular masses of approximately 70 and 80 kDa. The complex functions as a single-stranded DNA-dependent ATP-dependent helicase. The complex may be involved in the repair of nonhomologous DNA ends such as that required for double-strand break repair, transposition, and V(D)J recombination. High levels of autoantibodies to p70 and p80 have been found in some patients with systemic lupus erythematosus. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:81987835-82040085 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 210 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
DNA Repair pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
2-LTR circle formation pathway
Integration of provirus pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
Signaling events mediated by HDAC Class III
BARD1 signaling events
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
Regulation of Telomerase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.288809 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010247 XM_006520440 XM_006520441 XM_006520442 XM_006520443 XM_006520445 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37153 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||