Mus musculus Gene: Acsl6 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172962.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Acsl6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | acyl-CoA synthetase long-chain family member 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020333 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
acyl-CoA synthetase long-chain family member 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164398:
The protein encoded by this gene catalyzes the formation of acyl-CoA from fatty acids, ATP, and CoA, using magnesium as a cofactor. The encoded protein plays a major role in fatty acid metabolism in the brain. Translocations with the ETV6 gene are causes of myelodysplastic syndrome with basophilia, acute myelogenous leukemia with eosinophilia, and acute eosinophilic leukemia. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:54303798-54364756 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Fatty Acyl-CoA Biosynthesis pathway
Triglyceride Biosynthesis pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Fatty acid biosynthesis pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Fatty acid degradation pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs pathway
Fatty Acyl-CoA Biosynthesis pathway
Triglyceride Biosynthesis pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Fatty acid biosynthesis pathway
Fatty acid degradation pathway
PPAR signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B0QZJ6 B1ARG5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 216739 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.267478 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001033597 NM_001033598 NM_001033599 NM_144823 XM_006532842 XM_006532843 XM_006532844 XM_006532845 XM_006532846 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24694 CCDS24695 CCDS24696 CCDS24697 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:894291 | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Acsl6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL596127 AL603822 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 216739 | ||||||||||||||||||||||||||||||