Mus musculus Gene: Pdzk1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-176513.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pdzk1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700023D20Rik; 2610507N21Rik; 4921513F16Rik; AI267131; AI314638; AL022680; D3Ertd537e; mPDZK1; Pdzd1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038298 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
PDZ domain containing 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000174827:
This gene encodes a PDZ domain-containing scaffolding protein. PDZ domain-containing molecules bind to and mediate the subcellular localization of target proteins. The encoded protein mediates the localization of cell surface proteins and plays a critical role in cholesterol metabolism by regulating the HDL receptor, scavenger receptor class B type 1. Single nucleotide polymorphisms in this gene may be associated with metabolic syndrome, and overexpression of this gene may play a role in drug resistance of multiple myeloma. Pseudogenes of this gene are located on the long arm of chromosome 1. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:96829284-96870926 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.489677 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001146001 NM_021517 XM_006501831 XM_006501832 XM_006501833 XM_006501834 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17649 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||