Mus musculus Gene: Trafd1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197203.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trafd1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | TRAF type zinc finger domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000042726 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
TRAF type zinc finger domain containing 1
TRAF type zinc finger domain containing 1
TRAF type zinc finger domain containing 1
TRAF type zinc finger domain containing 1
TRAF type zinc finger domain containing 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRAFD1 deficiency reveals its negative regulatory role in the TLR and RIG-I-like helicases signalling pathway and was found to interact with TRIF, IPS-1, TRAF3 and TRAF6 in mice
[Homo sapiens] TRAFD1 is an interferon and LPS inducible gene acting as a negative regulator of Toll-like receptor signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000135148:
The innate immune system confers host defense against viral and microbial infection, and TRAFD1 is a negative feedback regulator that controls excessive immune responses (Sanada et al., 2008 [PubMed 18849341]).[supplied by OMIM, Dec 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:121371725-121385632 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.20488 Mm.482853 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001163470 NM_172275 XM_006530300 XM_006530301 XM_006530302 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51638 CCDS51639 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||