Homo sapiens Gene: ATG12 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37900.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG12 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 12 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | APG12; APG12L; FBR93; HAPG12 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000145782 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
ATG12::ATG5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. ATG12::ATG5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Atg12::Atg5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. Atg12::Atg5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Autophagy is a process of bulk protein degradation in which cytoplasmic components, including organelles, are enclosed in double-membrane structures called autophagosomes and delivered to lysosomes or vacuoles for degradation. ATG12 is the human homolog of a yeast protein involved in autophagy (Mizushima et al., 1998 [PubMed 9852036]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:115828200-115841858 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 57 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.737358 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001277783 NM_004707 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4122 CCDS64222 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 08496 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||