Homo sapiens Gene: HSD17B4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-38417.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HSD17B4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DBP; MFE-2; MPF-2; PRLTS1; SDR8C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000133835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a bifunctional enzyme that is involved in the peroxisomal beta-oxidation pathway for fatty acids. It also acts as a catalyst for the formation of 3-ketoacyl-CoA intermediates from both straight-chain and 2-methyl-branched-chain fatty acids. Defects in this gene that affect the peroxisomal fatty acid beta-oxidation activity are a cause of D-bifunctional protein deficiency (DBPD). An apparent pseudogene of this gene is present on chromosome 8. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is a bifunctional enzyme that is involved in the peroxisomal beta-oxidation pathway for fatty acids. It also acts as a catalyst for the formation of 3-ketoacyl-CoA intermediates from both straight-chain and 2-methyl-branched-chain fatty acids. Defects in this gene that affect the peroxisomal fatty acid beta-oxidation activity are a cause of D-bifunctional protein deficiency (DBPD). An apparent pseudogene of this gene is present on chromosome 8. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:119452443-119637199 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Beta-oxidation of very long chain fatty acids pathway
Beta-oxidation of pristanoyl-CoA pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
alpha-linolenic (omega3) and linoleic (omega6) acid metabolism pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Primary bile acid biosynthesis pathway
Peroxisome pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000414 NM_001199291 NM_001199292 NM_001292027 NM_001292028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4126 CCDS56378 CCDS56379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||