Mus musculus Gene: Cpsf6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191782.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cpsf6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cleavage and polyadenylation specific factor 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000055531 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cleavage and polyadenylation specific factor 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111605:
The protein encoded by this gene is one subunit of a cleavage factor required for 3' RNA cleavage and polyadenylation processing. The interaction of the protein with the RNA is one of the earliest steps in the assembly of the 3' end processing complex and facilitates the recruitment of other processing factors. The cleavage factor complex is composed of four polypeptides. This gene encodes the 68kD subunit. It has a domain organization reminiscent of spliceosomal proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is one subunit of a cleavage factor required for 3\' RNA cleavage and polyadenylation processing. The interaction of the protein with the RNA is one of the earliest steps in the assembly of the 3\' end processing complex and facilitates the recruitment of other processing factors. The cleavage factor complex is composed of four polypeptides. This gene encodes the 68kD subunit. It has a domain organization reminiscent of spliceosomal proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:117344673-117380015 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 56 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by FGFR1 fusion mutants pathway
Signaling by FGFR mutants pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Signaling by FGFR1 mutants pathway
Disease pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.394529 Mm.405325 Mm.406914 Mm.409681 Mm.478884 Mm.479892 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001013391 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24193 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||