Homo sapiens Gene: LY96 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-25842.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LY96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lymphocyte antigen 96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ESOP-1; ly-96; MD-2; MD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000154589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lymphocyte antigen 96
lymphocyte antigen 96
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
LY96 (MD-2) recognizes only exogenous pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) when complexed with TLR2-CD14 or TLR4-CD14.
LY86 and CD180 interact directly with the TLR4 signalling complex, inhibiting its ability to bind microbial ligand.
LY96 is physically associated with TLR4 on the cell surface and confers responsiveness to lipopolysaccharide (LPS).
TLR4::LY96 functions as intracellular LPS sensor and triggers a unique set of LPS responses upon recognition of phagocytosed bacteria in macrophages. (Demonstrated in murine model)
Amino acid Phe126 of LY96 acts as a hydrophobic switch driving agonist-dependent contacts necessary for TLR4 dimerization and activation.
Morphine binds to LY96, triggering TLR4 oligomerization and induces neuroinflammation within the central nervous system.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Tlr4::Ly96 functions as intracellular LPS sensor and triggers a unique set of LPS responses upon recognition of phagocytosed bacteria in macrophages.
[Mus musculus] Amino acid Phe126 of Ly96 acts as a hydrophobic switch driving agonist-dependent contacts necessary for Tlr4 dimerization and activation. (Demonstrated in human)
[Mus musculus] Morphine binds to Ly96, triggering Tlr4 oligomerization and induces neuroinflammation within the central nervous system. (Demonstrated in human)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein which associates with toll-like receptor 4 on the cell surface and confers responsiveness to lipopolysaccyaride (LPS), thus providing a link between the receptor and LPS signaling. Studies of the mouse ortholog suggest that this gene may be involved in endotoxin neutralization. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:73991352-74029087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated induction of TAK1 complex pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
Activation of IRF3/IRF7 mediated by TBK1/IKK epsilon pathway
TRIF-mediated programmed cell death pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Immune System pathway
Activated TLR4 signalling pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
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KEGG |
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH |
Toll-like receptor signaling pathway pathway
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PID NCI |
Endogenous TLR signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.726603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001195797 NM_015364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56540 CCDS6216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||