Homo sapiens Gene: DDX1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30761.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DBP-RB; UKVH5d | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000079785 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 1
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
DDX1 is cytosolic viral sensor in dendritic cells that binds to dsRNA through its Helicase A domain. DDX1 then recruits DDX21, DHX36 and TICAM1 to mount type I interferon and cytokine response to poly I:C, Influenza A virus and reovirus. (Demonstrated in murine model)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Ddx1 is a cytosolic viral sensor in dendritic cells that binds to dsRNA through its Helicase A domain. Ddx1 then recruits Ddx21, Dhx36 and Ticam1 to mount type I interferon and cytokine response to poly I:C, influenza A virus, and reovirus.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
DEAD box proteins, characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. This gene encodes a DEAD box protein of unknown function. It shows high transcription levels in 2 retinoblastoma cell lines and in tissues of neuroectodermal origin. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:15591178-15631111 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p24.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 130 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.440599 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004939 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1686 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03158 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||