Homo sapiens Gene: TSC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9819.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TSC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tuberous sclerosis 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LAM; PPP1R160; TSC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000103197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
tuberous sclerosis 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Mutations in this gene lead to tuberous sclerosis complex. Its gene product is believed to be a tumor suppressor and is able to stimulate specific GTPases. The protein associates with hamartin in a cytosolic complex, possibly acting as a chaperone for hamartin. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:2047465-2088720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 115 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
FSH pathway
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REACTOME |
AKT phosphorylates targets in the cytosol pathway
PIP3 activates AKT signaling pathway
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
PI3K/AKT activation pathway
Regulation of Rheb GTPase activity by AMPK pathway
GAB1 signalosome pathway
Signaling by EGFR pathway
PI3K events in ERBB4 signaling pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Inhibition of TSC complex formation by PKB pathway
mTOR signalling pathway
PI3K Cascade pathway
Signaling by Insulin receptor pathway
IRS-related events triggered by IGF1R pathway
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R) pathway
PI3K events in ERBB2 signaling pathway
Signaling by ERBB2 pathway
PI-3K cascade pathway
Signaling by FGFR pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Constitutive PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
PKB-mediated events pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Innate Immune System pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Signal Transduction pathway
IRS-mediated signalling pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Insulin receptor signalling cascade pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
IRS-related events pathway
IGF1R signaling cascade pathway
PI3K/AKT Signaling in Cancer pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Downstream signaling events of B Cell Receptor (BCR) pathway
Disease pathway
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KEGG |
mTOR signaling pathway pathway
Insulin signaling pathway pathway
p53 signaling pathway pathway
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INOH |
Insulin receptor signaling pathway
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PID NCI |
Direct p53 effectors
mTOR signaling pathway
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
LKB1 signaling events
p38 signaling mediated by MAPKAP kinases
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.90303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000548 NM_001077183 NM_001114382 XM_005255527 XM_005255528 XM_005255529 XM_005255530 XM_005255531 XM_005255532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10458 CCDS45384 CCDS58408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||